همزمان با دهه کرامت و در سالروز فرخنده میلاد با سعادت حضرت امام علی بن موسی الرضا علیه افضل التحیه و الثناء، محل پژوهشکده علوم اسلامی وابسته به بنیاد پژوهشهای اسلامی آستان قدس رضوی افتتاح شد و مورد بهره برداری قرار گرفت.
شایان ذکر است بنیاد پژوهشهای اسلامی آستان قدس رضوی از سالها پیش، مجوز قطعی تأسیس پژوهشکده علوم اسلامی را از وزارت علوم، تحقیقات و فناوری دریافت نموده است و بر اساس تأکیدهای تولیت سابق آستان قدس رضوی، مبنی بر لزوم فعال سازی پژوهشکده یادشده، مجمع عمومی بنیاد پژوهشهای اسلامی در سال 1396 مقرر نمود نسبت به جذب عضو هیئت علمی اقدام نماید. از این رو اقدامات و مکاتبات لازم با مرکز جذب هیئت علمی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری صورت گرفت و برای اولین بار، اعلام نیاز بنیاد پژوهشهای اسلامی در فراخوان شهریور 1397 در سامانه مربوط ثبت شد.
پژوهشکده علوم اسلامی، سه گروه پژوهشی مصوب شامل: گروه فرهنگ، ادب و تمدن اسلامی، گروه علوم قرآنی و فقه جعفری و گروه تصحیح و ترجمه متون اسلامی دارد که ذیل عناوین این گروه‌ها برای جذب هیئت علمی اقدام نموده است.
در حال حاضر، تکمیل ظرفیت جذب هیئت علمی پژوهشکده در حال پیگیری است و امید می‌رود با عنایت حضرت حق اعضای شایستهای برای خدمت در این مرکز منتسب به عالم آل محمد علیهم السلام، حضرت امام علی بن موسی الرضا علیه السلام پذیرش شوند.
ساختمان پژوهشکده علوم اسلامی در طبق همکف ساختمان بنیاد پژوهشهای اسلامی قرار دارد.