از ابتدای تأسیس این مرکز تاکنون، پژوهش‌های ارزنده‌ای در رشته‌های گوناگون مرتبط با علوم قرآنی انجام شده است در همین راستا این مرکز، تا کنون 67 اثر ارزشمند با موضوع قرآن و علوم قرآنی و همچنین 255 اثر با محوریت حدیث پژوهی به چاپ رسانده و در اختیار علاقه‎مندان قرار داده است.
انجام فعالیت‌های قرآنی در حوزه فرهنگ مکتوب قرآن، تحقیقات عمیق و گسترده در معارف قرآنی به منظور بهره‌مندی هر چه بیشتر جامعه اسلامی از انوار این کتاب آسمانی، از مهم‌ترین اهداف گروه مطالعات قرآنی بنیاد پژوهش‌های اسلامی آستان قدس رضوی است.
همچنین از جمله فعالیت‌های پژوهشی ارزشمند صورت گرفته در این گروه،  می توان اثر نفیس و کم‌نظیر «المعجم فی فقه لغت قرآن و سر بلاغته» را نام برد، که تا کنون 38 جلد از آن به زیور طبع آراسته شده و جلد سی و نهم این کتاب ارزشمنددر آستانه چاپ قراردارد.
«آشنایی با علوم قرآنی»، «آیات العقاید»، «بررسی زیباشناسی تکرار در قرآن کریم»، «برگ هایی نفیس از قرآن های منسوب به ائمه»، «بهترین روش حفظ قرآن»، «پرتویی از هدایت قرآن»، «جامعه انسانی از دیدگاه قرآن مجید»، «خورشید تابان در علم قرآن»، «روش حفظ قرآن»، «سوره های قرآن دورنمایه و محورها»، «گیاهان در قرآن» و ... از جمله آثاری است که به همت گروه مطالعات قرآنی بنیاد پژوهش های اسلامی آستان قدس رضوی تولید شده است.
«آموزش روخوانی قرآن»، «آموزش قرآن در سیره نبوی»، «آموزش تجوید قرآن کریم»، «شیوه های تفسیر قرآن کریم» و «روش حفظ قرآن مجید» نیز از دیگر آثار منتشر شده در این گروه است که با محوریت آموزش این کتاب آسمانی تهیه و تنظیم شده است.
همچنین آثاری با عناوین «برگهایی نفیس از قرآن‌های منسوب به خط ائمه معصومین(ع)»،« تفسیر آیه هایی متشابه و مورد اختلاف»، «فرهنگ نامه قرآنی» و... از جمله آثار با محوریت قرآن است که از جمله آثار برگزیده این مرکز در محافل علمی بشمار می‌رود.
« آداب معاشرت از دیدگاه معصومین(ع)»، «آسیب شناسی حدیث»، «اتحاد امت»، «اربعین رضوی»، « امر به معروف و نهی از منکر در سیره رضوی»، «با زائران کوی رضا(ع)»، «جامع الاحادیث»، «ترادف قرآن»، «حدیث سلسله الذهب از دیدگاه اهل سنت» و ... نیز برخی از عناوین آثاری است که به همت گروه حدیث پژوهی به چاپ رسیده است.
گفتنی است؛گروه مطالعات قرآنی بنیاد پژوهش‌های اسلامی آستان قدس رضوی مهم‌ترین رسالت خود را نشر علوم اسلامی و قرآنی در پرتو پژوهش‌های بنیادی می‌داند. این گروه، بزرگترین گروه پژوهشی بنیاد پژوهش‌های اسلامی آستان قدس رضوی است که همزمان با تأسیس بنیاد پژوهش‌های اسلامی آستان قدس رضوی در سال 1363 به منظور تحقیقات در زمینه قرآن و علوم قرآنی و تألیف کتاب «المعجم فی فقه القرآن و سرّ بلاغته» تشکیل شد.